MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 20810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021888	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318739
2	NC_021888	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318739
3	NC_021888	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318739
4	NC_021888	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318739
5	NC_021888	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	527318739
6	NC_021888	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318739
7	NC_021888	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318739
8	NC_021888	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318739
9	NC_021888	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318739
10	NC_021888	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527318739
11	NC_021888	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318739
12	NC_021888	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318739
13	NC_021888	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318740
14	NC_021888	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318740
15	NC_021888	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318740
16	NC_021888	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527318740
17	NC_021888	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527318740
18	NC_021888	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318740
19	NC_021888	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318740
20	NC_021888	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318740
21	NC_021888	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318740
22	NC_021888	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	527318741
23	NC_021888	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318741
24	NC_021888	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	527318741
25	NC_021888	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318741
26	NC_021888	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318741
27	NC_021888	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318741
28	NC_021888	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318741
29	NC_021888	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318741
30	NC_021888	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318741
31	NC_021888	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318741
32	NC_021888	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318741
33	NC_021888	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318741
34	NC_021888	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318741
35	NC_021888	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	527318741
36	NC_021888	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	527318741
37	NC_021888	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318741
38	NC_021888	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318741
39	NC_021888	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318741
40	NC_021888	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527318741
41	NC_021888	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318741
42	NC_021888	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318741
43	NC_021888	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318741
44	NC_021888	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318741
45	NC_021888	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527318741
46	NC_021888	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527318741
47	NC_021888	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318741
48	NC_021888	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318741
49	NC_021888	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318741
50	NC_021888	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318741
51	NC_021888	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527318742
52	NC_021888	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318742
53	NC_021888	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318742
54	NC_021888	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527318742
55	NC_021888	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318742
56	NC_021888	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527318742
57	NC_021888	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318742
58	NC_021888	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527318742
59	NC_021888	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318742
60	NC_021888	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318742
61	NC_021888	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	527318742
62	NC_021888	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318742
63	NC_021888	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527318742
64	NC_021888	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	527318742
65	NC_021888	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318742
66	NC_021888	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	527318742
67	NC_021888	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527318742
68	NC_021888	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318742
69	NC_021888	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318742
70	NC_021888	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318742
71	NC_021888	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318742
72	NC_021888	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318742
73	NC_021888	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527318742
74	NC_021888	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318742
75	NC_021888	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527318742
76	NC_021888	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527318742
77	NC_021888	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318742
78	NC_021888	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318742
79	NC_021888	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318743
80	NC_021888	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318743
81	NC_021888	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318743
82	NC_021888	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527318743
83	NC_021888	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318743
84	NC_021888	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	527318743
85	NC_021888	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	527318743
86	NC_021888	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318743
87	NC_021888	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318743
88	NC_021888	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527318743
89	NC_021888	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	527318743
90	NC_021888	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318743
91	NC_021888	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318743
92	NC_021888	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318743
93	NC_021888	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318743
94	NC_021888	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318743
95	NC_021888	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318743
96	NC_021888	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	527318743
97	NC_021888	T	6	6	5610	5615	0 %	100 %	0 %	0 %	527318743
98	NC_021888	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318743
99	NC_021888	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318743
100	NC_021888	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527318743
101	NC_021888	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318743
102	NC_021888	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318743
103	NC_021888	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318743
104	NC_021888	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	527318743
105	NC_021888	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527318743
106	NC_021888	AG	3	6	6414	6419	50 %	0 %	50 %	0 %	527318744
107	NC_021888	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318744
108	NC_021888	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318744
109	NC_021888	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527318744
110	NC_021888	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527318744
111	NC_021888	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318744
112	NC_021888	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318744
113	NC_021888	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318744
114	NC_021888	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527318745
115	NC_021888	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318745
116	NC_021888	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527318745
117	NC_021888	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318745
118	NC_021888	TCG	2	6	7316	7321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318746
119	NC_021888	TCC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318746
120	NC_021888	GTT	2	6	7467	7472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318746
121	NC_021888	AC	3	6	7649	7654	50 %	0 %	0 %	50 %	527318746
122	NC_021888	T	6	6	7685	7690	0 %	100 %	0 %	0 %	527318746
123	NC_021888	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527318746
124	NC_021888	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527318746
125	NC_021888	TTA	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318746
126	NC_021888	A	6	6	7969	7974	100 %	0 %	0 %	0 %	527318746
127	NC_021888	T	6	6	8054	8059	0 %	100 %	0 %	0 %	527318746
128	NC_021888	TTC	2	6	8160	8165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318746
129	NC_021888	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527318747
130	NC_021888	GAA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318747
131	NC_021888	AG	3	6	8392	8397	50 %	0 %	50 %	0 %	527318747
132	NC_021888	ACC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527318747
133	NC_021888	CTT	2	6	8485	8490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318747
134	NC_021888	CT	4	8	8511	8518	0 %	50 %	0 %	50 %	527318747
135	NC_021888	GAG	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318747
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